Вот наш сюжет игра начинаеться с Наруто Шипунден!
Деревня
За этих два года деревня не очень то изменилась.Но все же построили новые здания.Жизнь шла б своим чередом если б не странные события.Кто то начал нападать на соседние деревни.Коноха тоже в опасности.Для этого Цунаде собирает совещание.Акацки хотят на него попасть чтоб заполучить хоть немного информации о странных нападениях.
Команда № 7
Прошло уже два года с тех пор как команда № 7 тренируется у трех легендарных ниндзя.И вот Наруто и Сакура возвращаются в деревню уже не маленькими детьми а взрослыми людьми.Они полны сил и готовы отправляться на очередную миссию из за которой они так тренировались.Тем временем в их команду добавляют некого Сая из АНБУ чтоб команда стала еще более сильной.
Тем временем Саске уже тоже довольно вырос и он уже не тот мальчик которым был раньше. Единственое что осталось у него от прошлой жизни это месть.Орочимару желает заполучить тело Саске, и Саске знает об этом.Ему всеравно.
Ино,Шикамару,Чоджм
За этих два года эта команда добилась большых успехов они тоже подросли и изменились.Ино как всегда жаждет приключений и ведет войну с Сакурой но теперь она уже не такая бурная как была когда то.Шикамару наверное из этой команды изменился больше всех он упорно тренировался этих два года чтоб помочь Наруто и Сакуре вернуть Саске.Но в кое чем он все же остался таким ленивцем как и был.Чоджи торже не отстает он выучил еще несколько новых техник но все то же обжора.
Хината, Шино, Киба,
Хината все еще влюблена в Наруто.И она осталась такой же тихой скромной девушкой но уже взрослее на два года.Она упорно тренрируеться со свои м братом Неджи и хочет достичь значительных результатов в мире ниндзя.Шино пожалуй остался таким же все тот же стиль что делает его необыкновенным среди ниндзя и все тот же ум.Киба с Акамару очень изменились.Акамару очень заметно повзрослел как и Киба.Они выучили много разных техник.
Тсунаде Шизуне Джирайя
Тсунаде все еще на посту хокаге деревни.Как всегда она не может разобраться с своей кучой бумаг на столе.Но на помощь ей всегда приходит ее верная подопечная Шизуне.Джирайя уже второй раз был при смерте на этот раз его сильно повредил Девьятихвостый (Наруто).На очередной тренировке он завладел телом Наруто.
Акацуки
Пейн посылает две групы на совещание в Коноху.Он хочет что то узнать о странных нападениях.На задание отправляються две пары Итачи и Кисаме а также Сасори и Дейдара.Тем временем как все Акацки прячуться в своем секретном логове.
Темари Гаара Канкуро.
Эта команда тоже достишла значительных успехов.Они все достигли уровня джонина.Их сенсей очень гордиться ими.Но их посылают на очередную миссию.Они должны быть на совещании и разузнать что то для Суны.